In samenwerking met Louis Poulsen en Jens Gudum ontwikkelde hij een reeks armaturen, zoals de DR wandarmatuur, de Makeup armatuur, de serie Studio, de Terminal wandarmatuur, de Terminal buitenlamp en de Transit wandarmatuur. Jens Ammundsen won verschillende prijzen, waaronder de iF Product Design Award voor uitmuntend design in 1999.
Op het gebied van bouwen heeft Jens Ammundsen altijd bijzondere nadruk gelegd op de interactie tussen details en het project als geheel. De focus van zijn ontwerpen lag met name op het doel van een gebouw, en hij smeedde de verschillende elementen samen tot overtuigende holistische oplossingen.
Jens Ammundsen heeft aan tal van projecten gewerkt, zoals aan het voormalige DR Radiohus-gebouw aan de Rosenørns Allé in Kopenhagen. Hij gaf ook leiding aan de verbouwing hiervan ten behoeve van de Koninklijke Deense Muziekacademie.